ZEISS - Bitplane Partnership

Your 3D Image Analysis Solution is realized from now on!

이제 한 차원 진보된 3D/4D 이미지 분석이 가능해집니다.

최근 자이스 코리아는 Bitplane사와 공식 파트너쉽을 통해 Imaris 소프트웨어를 활용한 광학 현미경부터 전자, X-ray 현미경 이미지 분석이 가능해졌습니다.

Imaris는 생명과학, 의학 및 이외 다양한 분야에 적용 가능한 3D/4D 분석 솔루션입니다. 사용자 인터페이스는 매우 이해하기 쉽게 디자인되어 있으며 간단한 조작으로 3D 분석, 데이터 처리 등 보다 완벽한 이미징 솔루션을 제공합니다.

*옵션 모듈은 기본적으로 Imaris 소프트웨어가 필요하며 이 외 다양한 옵션 모듈을 선택할 수 있습니다.

Imaris Software

Imaris는 레이저 현미경 및 광학 현미경 기반의 섹터 분할 시스템 또는 deconvolution 처리 등으로 얻은 3D/4D 이미지 데이터를 시각화하는 데 필요한 기능을 모두 갖춘 기본 소프트웨어입니다. 어떠한 관점에서든 신속하게 다양한 유형의 3D 결과를 만들 수 있습니다. 또한 렌더링 입체 및 평면 상을 동시에 표시할 수 있으며 만든 입체 이미지에서 간단한 회전부터 복잡한 동작의 동영상까지 쉽게 만들 수 있습니다. 저장은 QuickTime 또는 AVI 형식으로 저장 가능하므로 효과적인 프레젠테이션에 사용할 수 있습니다.

  • 2D 이미지에서 포인트 지정에 의한 수동 측정
  • 개체의 자동 분리 및 측정
  • 임의의 위치 및 각도에서 3D 이미지를 잘라 내부 관찰

3D 측정

Imaris Measurement Pro는 3D 이미지의 다양한 측정을 실시해 Imaris에서 구축한 동영상에서 통계 데이터로 정량화하는 옵션 모듈입니다. 모양, 크기, 밝기를 측정하여 이 값에 근거한 분류와 분리된 객체들을 필터링 가능합니다.

  • 3D 이미지 중 포인트 지정에 의한 두 점간의 거리, 보고자 하는 부분 카운트 등 수동 측정
  • Threshold 설정 후 측정 부분의 3D 이미지 구축, 각종 파라미터의 자동 측정
  • 통계 계산 및 출력

분석 - Imaris Track

Imaris에서 분리된 세포, 분자, 핵산, 지질 이외 기타 많은 개체의 시간축 궤적을 2D/3D 이미지를 파악하고 분석하는 옵션 모듈입니다. Threshold 설정 후 해당 개체를 자동으로 인식하여 이동량과 이동 속도를 측정하고 그 궤적을 이미지에 표시합니다. 또한 클릭한 단일 대상을 추적하여 개체의 분열과 융합, 겹침 상태 등을 관찰할 수 있습니다.

  • 다양한 움직임의 객체를 추적하는 알고리즘
  • 궤적의 시각화를 효과적으로 하는 여러 표현 기법
  • Measurment Pro의 조합으로 매개 변수 측정 및 색상에 의한 코딩

분석 - Imaris Coloc

이 분석 툴은 다중 형광 이미지 데이터의 분석 옵션 모듈입니다. 슬라이스 이미지를 확인하면서 intesity 기반 또는 2D 히스토그램에서 관심 영역을 지정합니다. 지정된 영역에서 새로운 채널로 볼륨 정보에 추가된 부분을 컬러로 표시할 수 있으며 입체적으로 부분 분석이 가능합니다.

  • Voxel의 2D/3D/4D 이미지 중에서 선택 (수동, 반자동, 자동)
  • 히스토그램에 의한 영역 확인 및 선택
  • Colocalization 관련 다양한 측정 및 모든 시간의 포인트 데이터 표시 가능

필라멘트 분석 - Filament Tracer

신경 미세 소관 혈관 등 필라멘트 구조의 객체를 자동으로 감지하여 분기 상태를 분석하기 위한 옵션 모듈입니다. 설정한 밝기 값을 바탕으로 자동 감지하여 3D 모델을 측정하고 자동으로 감지할 수 없는 부분은 2D 이미지를 확인하면서 수동으로 추적하고 정확한 3D 모델을 만들 수 있습니다. 또한 만들어진 모델은 Imaris에서 만든 3D 이미지와 겹쳐서 확인할 수 있습닌다. 이 모델은 분기점마다 분할된 세그먼트 길이와 부피, 평균 직경 분기점의 수 등의 단위로 분석 가능합니다. (Measurement Pro가 필요합니다.)

  • 필라멘트의 중심 축을 자동 인식
  • 수동에서 자동까지 4종류의 추적 방법을 지원

Imaris Cell

Imaris Cell은 세포 및 구성 요소의 2D/3D/4D 분석 기능으로 세포 내부의 핵 또는 세포 소기관 등을 자동으로 추출하는 옵션 모듈입니다. 추출된 개체는 표면 렌더링을 할 수 있으며 2D/3D/4D의 분석을 가능하게 하는 플랫폼을 제공합니다. 세포와 세포 집단 단위로 정량화하여 객체 간의 관계를 분석할 수 있습니다.

  • 세포 간의 상호 작용 분석
  • 세포 내 기관의 상호 작용 분석
  • 통계 검색 (Measurement Pro가 필요)
  • 시간축 방향 분석 (Track 필요)

데이터 처리 - Imaris Vantage

Box and whisker plot을 이용하여 데이터를 비교 및 대조할 수 있는 옵션 모듈입니다. 이미지 데이터를 5차원으로 시각화함으로써 복잡하고 역동적인 현상의 해석을 도와줍니다. Imaris Vantage는 자유롭게 변경 가능한 주석으로 시리즈를 구축하여 다차원 개체가 많은 이미지에서 필요한 부분을 필터링하는 것을 가능하게 하여 매개 변수 개체, 개체군 사이의 관련성 등 이에 대한 이해를 돕습니다. Measurement Pro와 연계하여 방대한 통계를 바탕으로 주요 통계를 이미지의 오브젝트 주석으로 3D/4D 이미지의 원하는 위치에 넣을 수 있는 자료로 쉽게 만들 수 있습니다.

  • 이미지 구현 및 탐색
  • 이미지의 기초가 되는 수치 테이블
  • 주석 삽입 및 주석 이미지 만들기

Imaris 소프트웨어를 위한 이미징 시스템

Confocal Laser Scanning Microscope(CLSM)

Lightsheet fluorescence Microscope(LSFM)

  • 모델 동물(C.elegnas, Drosophila, Zebrafish 등)의 장시간 3D 실험
  • 조직 투명화(Tissue Clearing) 처리된 장기 또는 조직의 large volume 3D Imaging 및 분석
  • Lightsheet Z.1

Fluorescence Microscope

다양한 형광현미경 적용

  • Clearview TM 소프트웨어를 이용한 Deconvolution 처리로 신호 대 잡음비가 우수한 형광 이미지 제작 및 분석
  • Axio Imager Z2
  • Axio Observer 7

Electron Microscope

ZEISS Crossbeam 550

X-ray Microscope

ZEISS Xradia 620 Versa X-ray microscope
  • 마이크로 CT 및 X-ray 현미경으로부터 얻은 large volume 3D reconstruction 및 분석
  • X-ray Solutions